Den 22-årige spanske Honda-føreren sikret seg beste startspor på Rio Hondo-banen for annet år på rad.
– Jeg er fornøyd med at vi greide å sikre beste startspor. Det er viktig å starte fra første rekke her, for banen er skitten, og det gjør det vanskeligere å kjøre forbi, sa han.
Kvalifiseringen ble avviklet i trykkende varme, og søndag er det varslet enda høyere temperatur.
Marquez vant kvalifiseringen foran landsmannen Aleix Espargaro (Suzuki) og italienske Andrea Iannone (Ducati).
Tidligere verdensmester Jorge Lorenzo og legenden Valentino Rossi (begge Yamaha) ble bare nummer fem og åtte, men Marquez utropte dem likevel til sine farligste rivaler i løpet. (©NTB)